SmGDB
收藏国家生物信息中心2025-10-11 更新2025-03-15 收录
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资源简介：
SmGDB (S. miltiorrhiza genome database; http://8.140.162.85/ ), which houses the latest version of genome sequence and annotation data for S. miltiorrhiza, combining three unpublished RNA-Seq data from our group and two released RNA-Seq data. We also identified a novel gene cluster including seven CYP71D genes involved in the tanshinone synthesis pathway based on genome sequences and expression data.
SmGDB（丹参基因组数据库，S. miltiorrhiza genome database），其官方访问地址为http://8.140.162.85/。该数据库收录了丹参的最新版基因组序列与注释数据，整合了本研究团队未发表的3套RNA测序（RNA-Seq）数据以及2套已公开的RNA测序数据集。此外，研究团队基于基因组序列与表达数据，鉴定得到一个包含7个CYP71D基因的全新基因簇，该基因簇参与丹参酮（tanshinone）的生物合成途径。
提供机构：
Shandong Agricultural University
创建时间：
2023-09-06
搜集汇总
背景与挑战
背景概述
SmGDB是丹参基因组数据库，包含最新基因组序列和注释数据，整合了多组RNA-Seq数据，并识别出与丹参酮合成相关的CYP71D基因簇。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
