Pairpot

Pairpot is a database tailored for paired single-cell and SRT data with real-time heuristic analysis. Pairpot curates 99 high-quality pairs including 1,425,656 spots from 299 datasets, and creates the association networks. It constructs the curated pairs by integrating multiple slices and establishing potential associations between single-cell and SRT data.Pairpot是一款专为配对单细胞与空间转录组学（Spatial Transcriptomics, SRT）数据打造、支持实时启发式分析的数据库。该数据库收录了99组高质量配对样本，涵盖来自299个数据集的1,425,656个空间位点，并构建了关联网络。其通过整合多份组织切片，建立单细胞数据与SRT数据间的潜在关联，以此构建上述经筛选的配对样本集。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Pairpot是一个专为配对单细胞与空间转录组数据设计的数据库，具备实时启发式分析功能。它整合了来自299个数据集的99对高质量配对，包含1425656个点，并通过整合多切片与建立关联网络来构建数据对。该数据库提供Lasso-View、Pair-View和Layer-View等核心分析工具，支持用户在3D分层布局中实时探索空间聚类、细胞类型比例及基因表达。