杉木基因组调查(杉木纯林):基因组ssr的鉴定演示它们的效用遗传多样性分析

杉木是我国重要的针叶树种，占我国商品用材总产量的20 - 30 %。虽然传统育种取得了显着的成功，但由于基因组信息有限，分子辅助育种进展甚微。本研究利用Illumina HiSeq Xten测序平台对杉木基因组进行了调查。K-mer分析表明，杉木基因组约为11.6Gb，含有74.89 %的重复元件，高度杂合。同时，利用流式细胞术估算其基因组大小为13.2Gb。总共778.02Gb的清洁片段组装成10，982，272个支架，N50为1.57kb。共检测到362,193个SSR位点，检测频率为13.18kb。二核苷酸重复序列最丰富(占总ssr的73.6%)，其次是三核苷酸和四核苷酸重复序列。增添了46个多态性对，从199个中国杉木无性系中成功扩增了298个等位基因。平均PIC值为0.53，表明所鉴定的基因组SSR(gSSR)标记具有高度的多态性。此外，这些育种资源被分为三组，推断组中存在有限的基因群。