Interrogating the diurnal transcriptome of the muscle autonomous clock in vivo

In this study, we used RNA sequencing to interrogate which aspects of circadian gene expression in skeletal muscle are autonomous or require clocks in other tissues WT, KO and skeletal muscle Bmal1 reconstituted mice ( see Koronowski et al Cell 2019 and Greco et al Science Advances 2021 for general model description) were used to collect tissues at 6 time points over the diurnal cycle - 12 hr light: 12 hr dark conditions and ad libitum feeding of normal chow; tissues harvested at ZT0, 4, 8, 12, 16, 20本研究通过RNA测序（RNA sequencing）技术，探究骨骼肌节律基因表达的哪些调控环节具有自主性，或是依赖其他组织的生物钟调控。本研究使用野生型（WT，Wild Type）、基因敲除型（KO，Knockout）及骨骼肌Bmal1重组小鼠，相关模型的一般描述详见Koronowski等2019年发表于《Cell》及Greco等2021年发表于《Science Advances》的研究；实验采用12小时光照:12小时黑暗的昼夜周期条件，以自由采食普通饲料的方式饲养小鼠，并于节律时间（Zeitgeber Time，ZT）0、4、8、12、16、20六个时间点采集组织样本。