biopsy_spatial_CosMx.h5ad
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资源简介：
CosMx 960-plex RNA-ISH dataset of formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) colon biopsies from healthy controls and patients with ulcerative colitis on aminosalicylates or vedolizumab. Addendum 8/29/24: added expression matrix, metadata, and fov positions files
CosMx 960重RNA原位杂交（RNA-ISH）数据集，样本来源于健康对照个体与接受氨基水杨酸类药物或维多珠单抗治疗的溃疡性结肠炎患者的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）结肠活检组织。2024年8月29日增补：新增表达矩阵、元数据及视野位置文件。
提供机构：
figshare创建时间：
2023-01-18
搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
该数据集是一个基于CosMx 960-plex RNA-ISH技术的空间转录组学数据集，包含FFPE结肠活检样本，样本来源包括健康对照和接受aminosalicylates或vedolizumab治疗的溃疡性结肠炎患者。数据集提供了表达矩阵、元数据和视野位置文件，总大小2.91 GB，适用于结肠疾病的空间基因表达分析研究。
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