biopsy_spatial_CosMx.h5ad

CosMx 960-plex RNA-ISH dataset of formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) colon biopsies from healthy controls and patients with ulcerative colitis on aminosalicylates or vedolizumab. Addendum 8/29/24: added expression matrix, metadata, and fov positions files

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是一个基于CosMx 960-plex RNA-ISH技术的空间转录组学数据集，包含FFPE结肠活检样本，样本来源包括健康对照和接受aminosalicylates或vedolizumab治疗的溃疡性结肠炎患者。数据集提供了表达矩阵、元数据和视野位置文件，总大小2.91 GB，适用于结肠疾病的空间基因表达分析研究。