Pinto et al, 2022. Behavioral data in the accumulating-towers task with optogenetic inactivation of 9 sets of cortical regions during six different trial epochs

Hdf5 file containing a python dictionary with multiple arrays, the majority of them of length N where N is the number of behavioral trials, concatenated across mice and behavioral sessions. <br> 'choice', # N-element array of 0s and 1s indicating left or right choice, respectively 'cueOnset_L', # N-element array with arrays of left-tower onset times in sec for each trial, where t = 0 is trial start 'cueOnset_R', # N-element array with arrays of right-tower onset times in sec for each trial, where t = 0 is trial start 'cuePos_L', # N-element array with arrays of left-tower positions in cm. Towers appear when the mouse is 10 cm away from them 'cuePos_R', # N-element array with arrays of right-tower positions in cm. Towers appear when the mouse is 10 cm away from them 'epochList', # list of unique inactivation epochs. See referenced paper for details 'inactLocationList', # list of unique inactivation locations. See referenced paper for details 'laserEpoch', # N-element array with per-trial inactivation epoch 'laserEpoch_yposRange', # N-element array with [start end] position of laser inactivation in cm 'laserON', # N-element boolean array, True indicates laser inactivation trial 'loclbl', # N-element array with per-trial inactivation location 'mouseID', # N-element array with mouse number IDs 'nCues_RminusL', # N-element array with overall \Delta towers (#R - #L) for each trial 'pos', # N-element array with arrays indicating [x y theta] position for each time point in the trial. Theta is virtual view angle 'sessionID', # N-element array with unique session IDs per mouse 'time', # N-element array with arrays of time stamps in sec for each trial 'trialType', # N-element array of 0s and 1s indicating left or right trial (i.e. in which side the reward is), respectively 'viewAngle_byYpos', # N-element array with theta by position 'ypos_vals', # vector of y positions in cm used to calculate viewAngle_byYpos 'leftCode', # convention -- value used to indicate left side (= 0) 'rightCode' # convention -- value used to indicate right side (= 1)

本数据集为HDF5格式文件，内含一个Python字典，存储多组数组。其中绝大多数数组的长度为N，N为行为试验总次数，且已按小鼠和行为会话完成拼接。
'choice'：长度为N的0/1数组，分别用于指示小鼠选择左侧或右侧目标；
'cueOnset_L'：长度为N的数组，每个元素为对应试验中左侧塔的出现时刻（单位：秒），试验开始时刻记为t=0；
'cueOnset_R'：长度为N的数组，每个元素为对应试验中右侧塔的出现时刻（单位：秒），试验开始时刻记为t=0；
'cuePos_L'：长度为N的数组，每个元素为对应试验中左侧塔的空间位置（单位：厘米），当小鼠距离该塔10厘米时，塔会显现；
'cuePos_R'：长度为N的数组，每个元素为对应试验中右侧塔的空间位置（单位：厘米），当小鼠距离该塔10厘米时，塔会显现；
'epochList'：唯一失活时段（epoch）列表，详细信息请参阅所引用的论文；
'inactLocationList'：唯一失活位置列表，详细信息请参阅所引用的论文；
'laserEpoch'：长度为N的数组，存储每一次试验对应的失活时段（epoch）；
'laserEpoch_yposRange'：长度为N的数组，每个元素为形如[start end]的数组，表示激光失活时小鼠的y轴位置范围（单位：厘米）；
'laserON'：长度为N的布尔数组，True表示该试验为激光失活试验；
'loclbl'：长度为N的数组，存储每一次试验对应的失活位置标签；
'mouseID'：长度为N的数组，存储小鼠编号ID；
'nCues_RminusL'：长度为N的数组，存储每一次试验的塔数差值（右侧塔数量减去左侧塔数量）；
'pos'：长度为N的数组，每个元素为对应试验中各时间点的[x, y, theta]位置数组，其中theta为虚拟视角角度；
'sessionID'：长度为N的数组，存储每只小鼠的唯一会话ID；
'time'：长度为N的数组，每个元素为对应试验中各时间点的时间戳（单位：秒）；
'trialType'：长度为N的0/1数组，分别用于指示左侧或右侧试验（即奖励所在的一侧）；
'viewAngle_byYpos'：长度为N的数组，存储基于位置计算得到的视角theta；
'ypos_vals'：用于计算viewAngle_byYpos的y轴位置向量（单位：厘米）；
'leftCode'：约定编码值，用于表示左侧侧别，固定为0；
'rightCode'：约定编码值，用于表示右侧侧别，固定为1

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集记录了小鼠在执行accumulating-towers任务时的行为数据，同时进行了9组皮质区域的光遗传学失活，覆盖了六个不同的试验时期。数据以HDF5格式存储，包含多个数组，详细记录了试验的选择、塔的起始时间和位置、失活信息等关键行为数据。