SETD2甲基转移酶与hnRNP L/LL相互作用调控协同转录剪接的结构基础

可变剪接主要由RNA结合蛋白（RBP）调控。异质核糖核蛋白hnRNP L及其同源蛋白hnRNP LL，通过其四个保守的RRM结构域识别内含子或外显子序列上的CA富集区域，调控可变剪接的发生，进而影响生物发育和肿瘤发生等过程。然而，hnRNP L/LL如何与转录机器耦合，从而在共转录过程中实现可变剪接调控的分子机制仍然不明。本研究分析了hnRNP L与SETD2_SHI互作的分子机制。首先，通过等温滴定量热（ITC）实验发现，hnRNP L与SETD2_SHI中的一段高度保守的肽段特异性相互作用，并解析了hnRNP L_RRM2与SETD2_SHI肽段的复合物结构。结构显示，SETD2 高度保守区段内的一对亮氨酸将其侧链分别插入hnRNP L RRM2表面形成的两个疏水口袋中。其次，结合质谱、体内实验和ITC实验表明，hnRNP L的同源蛋白hnRNP LL_RRM2在体内和体外均与SETD2_SHI结合，并解析了hnRNP LL_RRM2与SETD2_SHI截短的核心保守肽段的复合物晶体结构。通过比较分析两个复合物的结构，鉴定出介导相互作用的关键残基，并结合ITC实验验证了这些残基的重要性。SETD2中的亮氨酸突变还导致其与包括hnRNPs在内的其他pre-mRNA 剪接相关蛋白的相互作用减少。本数据集内容为hnRPP L/LL-SETD2调控可变剪接的分子机制研究。在中国科学技术大学开展的实验包括hnRNP L/LL的表达纯化，ITC实验，蛋白质结晶，和蛋白质结构解析方面。数据集包括表达纯化，ITC，蛋白质结晶和结构解析相关的项目文件和原始数据文件。项目相关的研究内容已经于2021年发表于Nature Communications。