盘苔的全质体基因及石莼目中近缘种的比较分析

本研究首次对盘苔的叶绿体全基因组进行了鉴定，并与石莼目中6个近缘种进行了比较分析。盘苔的叶绿体基因组长度分别为170、562 bp，总体结构与Ulva和Pseudoendoclonium相似，但GC含量不同。共标注了113个独特基因，其中蛋白编码基因84个，tRNA 26个，rRNA 3个。与局部共线相比，存在更高水平的重排和较小的共线块。密码子使用分析鉴定出30个A端或u端偏置密码子。序列分析共检测到23个正向重复序列、18个回文重复序列、8个反向重复序列和38个不同类型的ssr。基于叶绿体全基因组的系统发育分析表明，Blidingia更接近Ulva而不是Pseudoendoclonium，为进一步研究打下基础。