RPAN
收藏知名数据库2026-06-11 收录
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RPAN contains a database of the basic information of 3010 rice accessions, including genomic sequences, gene annotations, PAV information and gene expression data of the rice pan-genome. RPAN also provides multiple search and visualization functions. RPAN can be a rich resource for rice biology and rice breeding.
RPAN 构建了涵盖3010份水稻种质资源基础信息的数据库，其中包含水稻泛基因组的基因组序列、基因注释、存在/缺失变异（PAV，Presence/Absence Variation）信息以及基因表达数据。RPAN 同时提供多种检索与可视化功能，可作为水稻生物学研究与水稻育种工作的宝贵资源。
提供机构：
上海交通大学搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
RPAN是一个水稻泛基因组数据库，基于3010个水稻种质的基因组数据构建，提供约641Mbp的泛基因组序列、基因注释、存在-缺失变异和表达谱等信息。该数据库集成了搜索与可视化功能，支持对水稻生物学和育种研究的数据查询与分析。
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