UNITE database
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资源简介:
UNITE是一个面向真核生物(特别是真菌)分子鉴定的网络数据库与序列管理平台,专注于核糖体DNA的ITS区域。其核心特色是构建了DNA水平的“物种假说”,即通过序列相似性聚类,为每个假想物种分配唯一的数字对象标识符,实现不同研究中物种信息的精确引用与沟通。该数据库整合了来自全球公共数据库的ITS序列及用户提交的序列,数据经专家社区持续整理和注释。UNITE提供下载预编译参考数据集,支持本地序列比对及高通量测序分析,广泛应用于环境DNA调查、微生物群落多样性和生物地理学等研究领域。
提供机构:
unite.ut.ee
搜集汇总
背景与挑战
背景概述
UNITE database是一个专注于真核生物(尤其是真菌)分子鉴定的数据库平台,核心特色在于构建DNA水平的'物种假说',通过ITS序列相似性聚类分配唯一标识符,实现物种信息的精确引用。它整合全球公共和用户提交的ITS序列,提供预编译参考数据集,支持本地比对和高通量测序分析,广泛应用于环境DNA调查、微生物群落多样性等研究领域。
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