GenBank sequences.rar

Oides decempunctatus 是一种寄生在葡萄科植物上的昆虫，对葡萄芽和叶造成重大损害。本研究成功确定了 O. decempunctatus，并分析了其基因结构和 Chrysomelidae 科内的系统发育关系。使用 Illumina HiSeq 平台，O. decempunctatus进行了测序，以检查其基因组结构特征和核苷酸组成。根据 13 个蛋白质编码基因和 2 个 rRNA 基因的序列，以及来自 GenBank 的 24 个 Chrysomelidae 物种的完整线粒体基因组序列，我们从 Chrysomelin 亚科中选择了两个物种，Chrysomela vigintipunctata 和 Chrysomela aeneicollis作为 outgroups 进行访问。系统发育树是使用最大似然和贝叶斯推理方法构建的。O. decempunctatus长 16,062 个碱基对，环状，双链，包含 22 个 tRNA 基因、2 个 rRNA 基因、13 个 PCG 和一个对照区，其排列类似于已知的 Chrysomelidae 昆虫的祖先状态。系统发育分析结果表明，Chrysomelidae 昆虫形成一个高度支持的单系群。值得注意的是，在 Chrysomelinae 亚科中，Gastrolina depressa 和 Gastrolina thoracica 物种在两次分析中都与 Galerucinae 亚科聚集，形成具有高节点支持值的分支。此外，O. decempunctatus 和 G. depressa 是姐妹群，在最大似然和贝叶斯分析中均具有很高的支持率。本研究为进一步研究 Chrysomelidae 的线粒体基因组提供了重要的基础信息。