RefDB

The Re-referenced Protein Chemical shift Database (RefDB) is a database of carefully corrected or re-referenced chemical shifts, derived from the BioMagRes Bank. The process involves predicting protein 1H, 13C and 15N chemical shifts using X-ray or NMR coordinate data via SHIFTX and then comparing those predictions to the observed shifts reported in the BMRB (via SHIFTCOR). RefDB provides a standard chemical shift resource for NMR spectroscopists, wishing to derive or compute chemical shift trends in peptides and proteins.重新校准蛋白质化学位移数据库（Re-referenced Protein Chemical shift Database，RefDB）是一套源自生物磁共振数据库（BioMagRes Bank，以下简称BMRB），并经过精心校正或重新校准的化学位移数据库。其构建流程为：借助SHIFTX软件，利用X射线或核磁共振（Nuclear Magnetic Resonance）坐标数据预测蛋白质的1H、13C及15N化学位移，随后通过SHIFTCOR软件将上述预测结果与BMRB中报道的实测化学位移进行比对。RefDB可为核磁共振波谱学家提供标准化的化学位移资源，以支持其推导或计算肽类与蛋白质中的化学位移趋势。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

RefDB是一个基于BioMagRes Bank重新校正蛋白质化学位移的数据库，通过SHIFTX和SHIFTCOR工具预测并比较1H、13C和15N化学位移，为NMR光谱学家提供标准资源以分析肽和蛋白质的化学位移趋势。该数据库包含2162个重校正文件，支持下载和搜索功能。