POMS | Tara Oceans analysis files
收藏DataCite Commons2025-05-01 更新2024-07-29 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/Tara_Oceans_analysis_files/20567598/2
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资源简介:
Input files used for running Tara Oceans analysis. <br> Includes: GToTree_output_modified.tre - Newick tree of MAGs kegg_pathways and kegg_modules - folders containing KEGG pathway and module abundance tables per MAG Table_S1_sample_info.txt - Sample metadata Table_S11_KO_abun.txt - KO copy number per MAG TARA_abundance_min_mean_coverage1.tsv - MAG abundance table (based on minimum breadth of coverage of 1%) <br>
本数据集为用于开展塔拉海洋(Tara Oceans)分析的输入文件,包含以下内容:
1. GToTree_output_modified.tre:针对宏基因组组装基因组(Metagenome-Assembled Genome, MAG)的Newick格式系统发育树(Newick tree)
2. 文件夹kegg_pathways与kegg_modules:内含各宏基因组组装基因组的KEGG通路(KEGG pathway)与KEGG模块(KEGG module)丰度表
3. Table_S1_sample_info.txt:样本元数据文件
4. Table_S11_KO_abun.txt:对应各宏基因组组装基因组的KO拷贝数表
5. TARA_abundance_min_mean_coverage1.tsv:基于1%最小覆盖广度计算得到的宏基因组组装基因组丰度表
提供机构:
figshare创建时间:
2022-08-26
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