Establishment and analysis of a novel miRNA prognostic risk model for bladder cancer based on TCGA database
收藏DataCite Commons2021-01-21 更新2024-08-18 收录
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膀胱癌是最常见的泌尿道肿瘤,并且由于缺乏可靠的诊断标记物,大多数膀胱癌被诊断为晚期。本研究在TCGA数据库中分析了膀胱癌患者的转录组和临床数据,经过预处理后将其分为试验组和验证组。首先,通过单变量Cox回归分析确定与膀胱癌预后密切相关的miRNA,然后通过多变量Cox回归分析建立基于miRNA表达谱的预后风险模型。通过ROC分析确定患者分类风险水平的最佳分界点,并在验证组和整个组中通过Kaplan-Meier估计来验证预后风险评分类型。 从miRTarBase,targetScan和miRDB的三个miRNA库中至少选择了两个可能的靶基因,并进行了KEGG途径和GO富集分析。所有这些交叉基因都是通过PPI网络和生存分析构建的。最后,建立了5-miRNA(hsa-miR-338-5p,hsa-miR-218-1-3p,hsa-miR-17-3p,hsa-miR-6728-5p,hsa-miR-10a- 3p)已成功构建。多变量Cox分析显示,它具有良好的可预测性,可作为预测膀胱癌患者预后和生存的新生物标志物,并可通过IGF1发挥其生物学功能。
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创建时间:
2021-01-21



