制药、化妆品、食品、环境、临床领域细菌16S 参考序列数据

制药、化妆品、食品、环境、临床领域发现的微生物经过16S rDNA序列测序后，利用获得的16S rDNA序列通过和本参考数据库序列联配进行细菌种属水平鉴定，以实现污染菌调查、监控、菌种资源的初步筛选，质控菌的确认等目的。微数通过查阅细菌合格发表文献、伯杰氏手册从公共数据库筛选合格发表的物种及代表菌株的16S rDNA序列，并通过进化分析、完整度检查（完整度大于70%）和质量检查（兼并碱基小于2%），建立高质量的16S rDNA数据库，并通过第三方训练的数据库进行比较分、阳性样本序列进行数据库的确认，最终建立高质量16S rDNA数据库，N碱基大于等于10比例低至0.7%以下，小于1100bp区域的不完整序列低至2%以下，优于目前的公开数据库。

搜集汇总

数据集介绍

特点

该数据集提供了制药、化妆品、食品、环境、临床领域细菌的16S rDNA参考序列数据，包含24536条记录，每年更新。数据通过严格的进化分析和质量检查，适用于细菌种属鉴定、污染菌调查和菌种资源筛选等应用。