LAMBench
收藏arXiv2025-04-28 更新2025-04-30 收录
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https://github.com/deepmodeling/lambench
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资源简介:
LAMBench是一个用于评估大型原子模型(LAMs)的基准测试系统,旨在衡量这些模型在多样性原子系统中的泛化性、适应性和适用性。该数据集包含八个在2025年4月1日前发布的先进LAMs,涵盖了无机材料、催化、反应、小分子和生物分子等五个科学领域。通过使用LAMBench,研究人员可以评估这些模型在预测能量、力和性质方面的准确性,并促进LAMs在科学发现和技术创新中的应用。
LAMBench is a benchmarking system for evaluating Large Atomic Models (LAMs), which aims to measure the generalization, adaptability and applicability of these models across diverse atomic systems. This dataset includes eight state-of-the-art LAMs released prior to April 2025, covering five scientific domains: inorganic materials, catalysis, reactions, small molecules and biomolecules. By utilizing LAMBench, researchers can assess the accuracy of these models in predicting energies, forces and properties, and facilitate the application of LAMs in scientific discovery and technological innovation.
提供机构:
AI for Science Institute, Beijing, China
创建时间:
2025-04-28
原始信息汇总
LAMBench数据集概述
数据集简介
LAMBench是一个用于评估机器学习原子间势(MLIPs)在多领域性能的基准测试工具。它提供全面的测试套件和指标,帮助开发者和研究人员理解机器学习模型的泛化能力。
核心目标
- 提供覆盖多领域原子系统的全面基准测试
- 与实际应用场景对齐,弥合基准测试性能与科学发现之间的差距
- 提供高区分度以区分不同性能的模型
- 支持持续改进,创建动态演进的基准测试
主要特性
- 全面的基准测试:包含多种下游任务的基准测试
- 易用性:简单快速的设置和配置
- 可扩展性:轻松添加新基准测试和指标
- 详细报告:生成详细的性能报告和可视化
数据获取
- 直接预测任务测试数据:https://www.aissquare.com/datasets/detail?pageType=datasets&name=LAMBench-TestData-v1&id=295
- 声子测试数据:https://www.aissquare.com/datasets/detail?pageType=datasets&name=LAMBench-Phonon-MDR&id=310
安装方式
bash pip install git+https://github.com/deepmodeling/LAMBench.git#egg=lambench[deepmd,mace,sevenn,orb]
使用说明
- 直接预测任务:使用
run_ase_dptest方法 - 计算器任务:使用
lambench.tasks.calculator中的脚本 - 微调任务:仅支持基于DeePMD-kit框架的模型
贡献指南
- 添加新模型:修改
lambench/models/models_config.yaml文件 - 添加新任务:修改
lambench/tasks/calculator/calculator_tasks.yml文件
许可证
MIT License
搜集汇总
数据集介绍

构建方式
LAMBench是一个专为评估大型原子模型(LAMs)设计的基准测试系统,旨在衡量这些模型在泛化性、适应性和适用性方面的表现。其构建过程涉及多个科学领域的数据集整合,包括无机材料、催化、反应、小分子以及生物分子和超分子等。通过自动化工作流程,LAMBench能够高效地执行任务计算、结果汇总与分析,确保评估过程的全面性和一致性。数据集的选择和清洗严格遵循科学标准,以确保数据的可靠性和代表性。
使用方法
使用LAMBench进行模型评估时,研究人员首先需要将目标模型集成到LAMBench工具包中,并通过ASE计算器接口与测试任务交互。系统支持自动化的工作流管理,包括任务提交、执行和结果分析。用户可以通过配置文件和数据库管理模型和任务,确保评估过程的高效性和可重复性。LAMBench还提供了交互式排行榜,方便研究人员直观地比较不同模型的性能。其动态和可扩展的设计使得未来可以轻松添加新的测试任务和数据集,以适应不断发展的科学需求。
背景与挑战
背景概述
LAMBench是由AI for Science Institute等机构的研究团队于2025年提出的一个基准测试系统,旨在评估大型原子模型(LAMs)在通用性、适应性和适用性方面的表现。该数据集的创建背景源于原子建模领域对通用势能面(PES)近似模型的迫切需求,特别是在多领域科学发现中的应用。LAMBench通过整合来自无机材料、催化反应、小分子和生物分子等五个科学领域的17个测试数据集,为LAMs的跨域性能评估提供了标准化平台。其核心研究问题聚焦于解决当前领域专用模型在泛化能力上的局限性,并通过多任务预训练策略推动原子建模向通用基础模型方向发展。该数据集对计算材料学、分子动力学和量子化学模拟等领域产生了深远影响,为AlphaFold2等突破性成果的出现奠定了方法论基础。
当前挑战
LAMBench面临的挑战主要体现在三个方面:在领域问题层面,需要解决不同研究领域间交换关联泛函差异导致的模型泛化障碍,如无机材料领域适用的PBE泛函与有机分子领域所需的ωB97X泛函间的精度鸿沟;在模型构建层面,数据采集面临多源异构DFT计算参数的标准化难题,例如周期性边界条件处理、赝势选择等带来的数据不可比性;在基准测试层面,如何设计既能反映真实应用场景又具备计算可行性的属性计算任务(如声子谱和扭转势能面预测)是一大挑战。此外,保持模型的能量守恒性和可微性以满足分子动力学模拟需求,同时兼顾计算效率以支持大规模体系模拟,构成了相互制约的技术难点。
常用场景
经典使用场景
LAMBench作为评估大型原子模型(LAMs)的基准系统,广泛应用于量子化学和材料科学领域。其经典使用场景包括评估模型在预测势能面(PES)时的泛化能力、适应性和适用性。通过多领域数据集测试,LAMBench能够全面衡量模型在无机材料、催化反应、小分子和生物分子等不同领域的表现,为研究者提供模型性能的客观比较。
解决学术问题
LAMBench解决了当前原子模型评估中存在的两大关键学术问题:一是领域特异性评估的局限性,二是实际应用场景的缺失。通过引入跨领域测试任务和物理性质计算基准,该数据集填补了通用势能面模型评估的空白,为量化模型在能量、力和性质预测中的误差提供了标准化方法,推动了多任务训练、多保真度建模等关键技术的发展。
实际应用
在实际应用中,LAMBench评估的模型可直接服务于材料设计、药物发现和催化研究等领域。例如,在锂离子电池材料开发中,通过LAMBench验证的高精度模型能准确预测材料的相稳定性和离子扩散系数;在分子动力学模拟中,经稳定性测试的保守性模型可确保长时间模拟的能量守恒,显著提升模拟结果的可靠性。
数据集最近研究
最新研究方向
近年来,LAMBench作为评估大型原子模型(LAMs)的基准系统,已成为计算化学和材料科学领域的前沿研究方向。该数据集通过系统化评估LAMs在泛化性、适应性和适用性三个维度的表现,揭示了当前模型与理想通用势能面(PES)之间的显著差距。研究指出,跨领域训练数据整合、多精度建模支持以及模型保守性和可微性保障是提升LAMs性能的关键路径。例如,DPA-2.4-7M模型通过多任务训练策略在无机材料和小分子领域展现出优越的泛化能力,但其在生物分子等复杂体系的性能仍落后于专用模型。此外,非保守性模型(如Orb-v2)虽在计算效率上具有优势,却因能量守恒问题限制了分子动力学模拟的稳定性。这些发现为开发兼具高精度与通用性的下一代原子模型提供了重要指导,同时也凸显了标准化评估框架对推动科学机器学习发展的重要作用。
相关研究论文
- 1LAMBench: A Benchmark for Large Atomic ModelsAI for Science Institute, Beijing, China · 2025年
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