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TSNAdb v2.0 combines the predcited results of DeepHLApan, MHCflurry and NetMHCpan v4.0 for the identification of higher confidence neoantigens derived from SNV, INDEL and Fusion, respectively.

TSNAdb v2.0 整合了DeepHLApan、MHCflurry与NetMHCpan v4.0的预测结果,可分别识别源自单核苷酸变异(SNV)、插入缺失变异(INDEL)以及融合事件(Fusion)的高置信度新抗原(neoantigens)。

提供机构:
浙江大学
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TSNAdb 数据集图片
背景与挑战
背景概述
TSNAdb v2.0是一个整合了DeepHLApan、MHCflurry和NetMHCpan v4.0预测结果的数据集,用于高置信度识别源自SNV、INDEL和Fusion等突变类型的新抗原。它提供了大量新抗原数据,包括共享预测新抗原和从其他数据库收集的条目,并与癌症驱动基因数据库链接,以支持肿瘤免疫治疗研究。
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