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Advanced_ML_Project

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Hugging Face2026-01-29 更新2026-01-30 收录
下载链接:
https://huggingface.co/datasets/sidms/Advanced_ML_Project
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官方服务:
资源简介:
该数据集包含两种流感病毒亚型(H1N1和H3N2)的基因序列数据,每个配置包含以下字段:序列ID(字符串类型)、基因序列(字符串类型)、年份(整型)和亚型(字符串类型)。数据集分为训练集和测试集,其中H1N1配置包含20,484个训练样本和5,122个测试样本,总大小约45.4MB;H3N2配置包含28,974个训练样本和7,244个测试样本,总大小约62.8MB。数据以分片文件形式存储,适用于流感病毒序列分析、时间序列预测或亚型分类等生物信息学任务。
创建时间:
2026-01-20
原始信息汇总

数据集概述

基本信息

  • 数据集名称: Advanced_ML_Project
  • 来源平台: Hugging Face
  • 数据集地址: https://huggingface.co/datasets/sidms/Advanced_ML_Project

数据集配置

该数据集包含两个独立的配置,分别对应两种流感病毒亚型。

配置一:H1N1

  • 特征字段:
    • id: 字符串类型,标识符。
    • sequence: 字符串类型,序列数据。
    • year: 整型(int64),年份。
    • subtype: 字符串类型,亚型。
  • 数据划分:
    • 训练集 (train): 20,484 个样本,大小约为 36.32 MB。
    • 测试集 (test): 5,122 个样本,大小约为 9.08 MB。
  • 数据量:
    • 下载大小: 约 12.30 MB。
    • 数据集总大小: 约 45.40 MB。
  • 文件路径:
    • 训练集: H1N1/train-*
    • 测试集: H1N1/test-*

配置二:H3N2

  • 特征字段:
    • id: 字符串类型,标识符。
    • sequence: 字符串类型,序列数据。
    • year: 整型(int64),年份。
    • subtype: 字符串类型,亚型。
  • 数据划分:
    • 训练集 (train): 28,974 个样本,大小约为 50.24 MB。
    • 测试集 (test): 7,244 个样本,大小约为 12.56 MB。
  • 数据量:
    • 下载大小: 约 18.18 MB。
    • 数据集总大小: 约 62.80 MB。
  • 文件路径:
    • 训练集: H3N2/train-*
    • 测试集: H3N2/test-*

总结

  • 总样本量: 两个配置合计共 64,824 个样本。
  • 总数据大小: 两个配置合计约 108.20 MB。
  • 核心内容: 该数据集包含H1N1和H3N2两种流感病毒亚型的序列数据,每个样本包含标识符、序列、年份和亚型信息,并已预先划分为训练集和测试集。
搜集汇总
数据集介绍
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构建方式
在流感病毒基因组学的研究领域中,Advanced_ML_Project数据集通过系统性地收集与整理H1N1和H3N2两种主要亚型的流感病毒序列数据构建而成。其构建过程依托于公开的生物信息学数据库,从原始序列中提取关键特征,并依据时间年份与病毒亚型进行结构化标注。数据被精心划分为训练集与测试集,确保了机器学习模型在时序预测与分类任务中能够获得充分且平衡的学习与验证样本,为后续分析奠定了可靠的数据基础。
使用方法
研究人员可通过HuggingFace数据集库直接加载Advanced_ML_Project,通过指定‘H1N1’或‘H3N2’配置名来访问特定亚型的数据。加载后的数据以标准化的字典格式呈现,包含‘id’、‘sequence’、‘year’和‘subtype’等字段,并已内置训练与测试划分。使用者可随即将其输入机器学习管道,用于训练病毒亚型分类器、探索序列随时间演化的规律,或构建预测模型,从而推动流感病毒的监测与防控研究。
背景与挑战
背景概述
Advanced_ML_Project数据集聚焦于流感病毒基因组序列分析,由相关研究机构于近年构建,旨在支持机器学习在生物信息学领域的应用。该数据集包含H1N1和H3N2两种亚型的病毒序列,每条记录涵盖序列标识符、基因序列、采集年份及亚型信息,为病毒进化追踪和亚型分类提供了结构化数据基础。其创建响应了公共卫生领域对流感病毒监测的迫切需求,通过整合时序性序列数据,促进了病毒变异模式识别和预测模型的发展,对流行病学研究和疫苗设计具有重要参考价值。
当前挑战
该数据集旨在解决流感病毒亚型分类与进化预测的挑战,涉及高维序列数据的特征提取和时序模式建模,需应对病毒快速变异带来的数据分布漂移问题。构建过程中,挑战包括从分散的公共数据库中收集和清洗大规模序列数据,确保年份标签的准确性和一致性,以及处理序列长度差异和噪声,以维持数据质量与可靠性。
常用场景
经典使用场景
在流感病毒进化与传播研究中,Advanced_ML_Project数据集通过提供H1N1和H3N2亚型的血凝素蛋白序列及其对应年份,为机器学习模型训练与评估奠定了数据基础。该数据集常用于构建时间序列预测模型,以分析病毒序列随时间的遗传漂变与抗原漂移,从而揭示流感病毒的进化动力学。研究人员利用其划分的训练集与测试集,能够系统性地开发分类或回归算法,预测病毒亚型的传播趋势或抗原特性,为理解流感病毒的适应性进化提供关键见解。
解决学术问题
该数据集有效解决了流感病毒学中若干核心学术问题,包括病毒亚型的时序演化模式识别、抗原变异预测以及跨年度传播风险评估。通过整合大规模序列数据与时间标签,它支持了基于深度学习的序列建模方法,克服了传统统计分析在捕捉复杂非线性进化关系上的局限。其意义在于推动了计算生物学与流行病学的交叉融合,为流感病毒的主动监测与预警提供了数据驱动的科学依据,显著提升了病毒进化研究的可预测性与精准度。
实际应用
在实际应用层面,Advanced_ML_Project数据集被广泛应用于公共卫生领域的流感疫苗设计优化与疫情预警系统中。基于该数据集训练的模型可辅助预测未来流行病毒株的抗原特征,指导疫苗株的年度筛选,提升疫苗匹配效率。同时,卫生机构可利用其分析结果评估不同亚型的传播潜力,制定针对性的防控策略,从而在流感季节前实现更有效的资源调配与风险沟通,保障公众健康安全。
数据集最近研究
最新研究方向
在流感病毒基因组学领域,Advanced_ML_Project数据集聚焦于H1N1和H3N2亚型的序列数据,为病毒进化与传播动态研究提供了关键资源。当前前沿方向集中于利用深度学习模型预测病毒抗原性漂移,结合时间序列分析揭示年度变异模式,以辅助疫苗株选择。热点事件如全球流感大流行预警推动了跨亚型比较学习的发展,通过整合多源序列特征提升早期检测能力。这些研究不仅深化了对流感病毒适应性机制的理解,也为公共卫生决策提供了数据驱动的科学依据,具有重要的流行病学意义。
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