CHAOS (CHAOS - Combined (CT-MR) Healthy Abdominal Organ Segmentation)

CHAOS 挑战旨在从 CT 和 MRI 数据中分割腹部器官（肝脏、肾脏和脾脏）。 CHAOS 现场部分于 2019 年 4 月 11 日在意大利威尼斯举行的 IEEE 国际生物医学成像研讨会 (ISBI) 上举行。仍然欢迎在线提交！ \textbf{挑战说明} 了解复杂医疗程序的先决条件对于手术的成功起着重要作用。为了丰富理解水平，医生使用 3D 可视化和打印等高级工具，这需要从 DICOM 图像中提取感兴趣的对象。因此，腹部器官（即肝脏、肾脏和脾脏）的精确分割对于包括但不限于活体供体移植手术的肝脏预评估或腹部器官的详细分析等临床程序至关重要。在腹主动脉手术前确定从它们产生和进入的血管，以便正确定位移植物。这激发了正在进行的研究以实现更好的分割结果并克服源自腹部高度灵活的解剖特性和反映到图像特征的模态限制的无数挑战。在这种情况下，提出的挑战有两个独立但相关的目标：1) 从计算机断层扫描 (CT) 数据集分割肝脏，这些数据集是在注射造影剂后在门静脉期获得的，用于对活体肝移植供体进行预评估。 2) 从用两个不同序列(T1-DUAL 和T2-SPIR) 采集的磁共振成像(MRI) 数据集分割四个腹部器官(即肝脏、脾脏、右肾和左肾)。 CHAOS 任务包含这些器官分割的组合。 \textbf{Tasks} 参赛队伍可以参加五个比赛类别并提交他们的结果： 1) 肝脏分割（CT 和 MRI）：这也称为“交叉模式”[1]，它只是基于使用单个系统，该系统可以从 CT 和 MRI 中分割肝脏。例如，机器学习方法的训练和测试集将包含来自两种模式的图像，而无需明确地为模型提供相应的信息。关于此的独特研究是下面的参考，该任务是挑战中最有趣的任务之一。请记住，不同模式的单个系统的融合（即两个模型，一个在 CT 上工作，另一个在 MRI 上工作）对这一类别无效。它们可以在任务 2 和 3 中作为单独的系统进行评估。另一方面，在此任务中，允许在 MR 序列之间融合单独的系统（即两个模型，一个在 T1-DUAL 上工作，另一个在 T2-SPIR 上工作）是允许的. 2）肝脏分割（仅限CT）：这主要是CT肝脏分割的常规任务，（例如SLIVER07）。这项任务比 SLIVER07 更容易，因为它只包含沿相同方向和患者位置排列的健康肝脏。然而，具有挑战性的部分是由于注射造影剂而增强的血管结构（门相）。 3）肝脏分割（仅MRI）：类似于“任务2”，这也是MRI肝脏分割的常规任务。它包括两种不同的脉冲序列：T1-DUAL 和 T2-SPIR。此外，T1-DUAL 有两种形式（进相和出相）。开发的系统应该在这两个序列上工作。在此任务中，允许在 MR 序列之间融合单个系统（即两个模型，一个在 T1-DUAL 上工作，另一个在 T2-SPIR 上工作）。 4) 腹部器官的分割（CT & MRI）：这项任务是任务 1 在 MRI 数据中对肾脏和脾脏的扩展。在这个任务中，有趣的部分是 CT 数据集只有肝脏，但 MRI 数据集有四个带注释的腹部器官（肝脏、肾脏、脾脏）。请记住，针对不同模式（即两个模型，一个在 CT 上工作，另一个在 MRI 上工作）的单个系统的融合对于此类别无效。另一方面，在此任务中，允许在 MR 序列之间融合单个系统（即两个模型，一个在 T1-DUAL 上工作，另一个在 T2-SPIR 上工作）。 5）腹部器官的分割（仅MRI）：与“任务3”中给出的相同任务，但扩展到四个腹部器官；肝、肾、脾。在此任务中，允许在 MR 序列之间集成或融合单个系统（即两个模型，一个在 T1-DUAL 上工作，另一个在 T2-SPIR 上工作）。 [1] Valindria, V. 等人。 （2018 年 3 月）。来自未配对图像的多模态学习：在 CT 和 MRI 中的多器官分割中的应用。 2018 年 IEEE 计算机视觉应用冬季会议 (WACV)（第 547-556 页）。 IEEE。 https://doi.ieeecomputersociety.org/10.1109/WACV.2018.00066