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OrthoMaM

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国家生物信息中心2025-10-11 更新2025-03-15 收录
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资源简介:

OrthoMaM is a database of ORTHOlogous MAmmalian Markers that we developed to describe the evolutionary dynamics of coding sequences in mammalian genomes.

OrthoMaM是我们开发的直系同源哺乳动物标记(Orthologous Mammalian Markers)数据库,用于描述哺乳动物基因组中编码序列的进化动态。

提供机构:
Univ. Montpellier
创建时间:
2024-07-16
搜集汇总
数据集介绍
OrthoMaM 数据集图片
背景与挑战
背景概述
OrthoMaM是一个专注于哺乳动物进化基因组学的数据库,基于NCBI数据库提取了190个物种的15868个1对1直系同源基因的编码序列(CDS),并利用先进的生物信息学工具(如MAFFT、MACSE、IQ-TREE)进行序列比对、清洗和系统发育分析,生成高质量的核苷酸和氨基酸比对以及系统发育树。该数据集已被252篇论文引用,广泛应用于哺乳动物进化研究,具有高度的专业性和可靠性。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
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