<b>的分布和进化分析 </b><b><i>大肠杆菌</i></b><b> 通过集成生物信息学分析大肠杆菌脱泛素酶 ElaD</b>
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病原体利用多种效应蛋白来调节关键的宿主信号通路,从而促进细菌存活并增强致病性。尽管缺乏自己的完整泛素系统,但细菌效应蛋白经常作为泛素连接酶或去泛素酶 (DUB) 发挥作用,以破坏真核泛素机制。在多种细菌中发现了 DUB,包括 ElaD,它最近被公认为<i>大肠杆菌</i>(<i>大肠</i>。然而,ElaD 在不同<i>大肠杆菌</i>在很大程度上仍然未知。在这项研究中,我们从 <i>elaD</i> 530 <i>大肠杆菌</i>。然后,通过生物信息学方法确定每个菌株的分子表征。还构建了系统发育树来分析不同 ElaD 之间的进化关系。 我们的研究结果表明,<i>elaD</i> 基因存在于 66.60% (353/530) 的致病性和非致病性<i>大肠杆菌</i>菌株中。 <i>elaD</i> 基因主要存在于 O157、O26、O139 和 O8 血清型中。大多数 <i>elaD</i>阳性菌株属于系统发育组 B1 、 A 、 E 和 D,主要序列类型为 ST11 、 ST21 、 ST10 、 ST1 和 ST69。 来自不同菌株的 ElaD 聚集在系统发育树中,与 O 血清型和系统发育组相关。 此外,一些分支的 ElaD 表现出过早的翻译终止。的广泛存在 <i>elaD</i> 基因在各种<i>大肠杆菌</i> 表明其在<i>大肠</i>致病性中的潜在意义,尽管其确切的功能作用仍有待阐明。
提供机构:
Wang, Xinyu创建时间:
2024-09-27



