scROAD

The scROAD database visualizes predicted single-cell transcription factor (TF) occupancy and regulatory networks derived from epigenomic studies of neurodegenerative tauopathies (Pick's disease, Alzheimer's disease). It highlights disease-specific alterations, including a human-gained enhancer (HGE) linked to UBE3A, AD risk loci enriched in microglial enhancers, and cell-type-specific (neurons/glia) TF binding patterns, validated by CRISPR excision of a predicted enhancer.scROAD数据库可视化了基于神经退行性tau蛋白病（皮克病、阿尔茨海默病）表观基因组学研究预测得到的单细胞转录因子（transcription factor, TF）占据情况与调控网络。该数据库着重展示了疾病特异性改变，包括与UBE3A基因相关的人类获得性增强子（HGE）、富集于小胶质细胞增强子的阿尔茨海默病风险位点，以及细胞类型特异性（神经元/胶质细胞）的转录因子结合模式，相关结果已通过对某预测增强子的CRISPR切除实验得到验证。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

scROAD是一个专注于神经退行性疾病的单细胞调控占据数据库，整合了单细胞ATAC-seq和转录组数据，以可视化转录因子结合位点和调控网络。它揭示了疾病特异性改变，如与UBE3A相关的人类获得性增强子，并支持通过CRISPR验证的细胞类型特异性转录因子结合模式分析，为研究阿尔茨海默病和皮克病的基因调控机制提供资源。