Wpływ wyciszenia AK4 na metabolizm i kinom komórek endotelium

Zbiór danych zawiera wyniki pojedynczego działania naukowego zrealizowanego w ramach konkursu MINIATURA finansowanego przez Narodowe Centrum Nauki. Celem przepowadzonych badań było wstępne poznanie efektów wyciszenia genu AK4 (kinazy adenylanowej 4) na metabolizm ludzkich pierwotnych komórek śródbłonka mikronaczyń płucnych (HPMEC) pozyskanych od trzech donorów, w warunkach normoksji i hipoksji (niedotlenienia). Wyciszanie genu AK4 przeprowadzono metodą bezwektorową z wykorzystaniem syntetycznych sekwencji siRNA. W badaniach zastosowaną niecelowaną analizę metabolomiczną z użyciem spektrometrii mas (QExactive Hybrid Quadrupole-Orbitrap), jak również technologię Seahorse w celu zbadania aktywności glikolitycznej w czasie rzeczywistym. Dodatkowo, dzięki współpracy z Uniwersytetem Justusa Liebiga w Giessen (Niemcy) zbadano efekt wyciszenia AK4 w komórkach HPMEC od trzech donorów na aktywność kinaz białkowych techniką mikromacierzy peptydowych (PamGene). Wyniki uzyskane w ramach zrealizowanego działania naukowego wskazują, że AK4 może regulować metabolizm podstawowy komórek HPMEC przez kontrolę szlaku glikolizy i cyklu TCA oraz szlaków transdukcji sygnałów zależnych od kinaz białkowych z rodziny Src i CDK. Należy podkreślić, że niecelowana analiza metabolomiczna oraz profilowanie kinomu to globalne analizy przesiewowe pozwalające wytypować możliwie najwiekszą liczbę metabolitów/sygnałów. Przed publikacją pełnego oryginalnego artykułu naukowego, zaplanowane jest potwierdzenie zidentyfikowanych różnic z wykorzystaniem analiz celowanych, np. z wykorzystaniem metabolomiki celowanej, testów biochemicznych i funkcjonalnych.