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Vcf-to-dadi perl script

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DataONE2017-02-13 更新2024-06-26 收录
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Demographic inferences (Figure S5a and b): Perl script that converts a vcf file including 2 or 3 pop with Ancestral Allele field (not necessary if folded) to a file for diffusion approximation demographic inference (dadi, Gutenkunst 2015, PLoS Genetics). Requires Bioperl, reference sequence fasta file, and variant file at VCF format (only with strains required for the analysis)
创建时间:
2017-02-13
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