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ptsw/ref_seq_viral_microsatellites

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Hugging Face2024-05-24 更新2024-06-12 收录
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https://hf-mirror.com/datasets/ptsw/ref_seq_viral_microsatellites
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官方服务:
资源简介:
Based on Hack90/ref_seq_viral, using pytrf with settings: ``` pytrf.STRFinder( seqdict['id'], seqdict['sequence'], mono=5, di=2, tri=2, tetra=2, penta=2, hexa=2 ) ``` and contains columns: ``` ['id', 'start_pos', 'end_pos', 'motif_seq', 'motif_length', 'repeats', 'ssr_length'] ```
提供机构:
ptsw
原始信息汇总

数据集概述

数据集来源与处理

  • 基于数据集 Hack90/ref_seq_viral,使用 pytrf 工具进行处理。

处理参数

  • 使用 pytrf.STRFinder 函数,参数设置如下:
    • mono=5
    • di=2
    • tri=2
    • tetra=2
    • penta=2
    • hexa=2

数据集结构

  • 包含以下列:
    • id
    • start_pos
    • end_pos
    • motif_seq
    • motif_length
    • repeats
    • ssr_length
5,000+
优质数据集
54 个
任务类型
进入经典数据集
二维码
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面向社区/商业的数据集话题

二维码
科研交流群

面向高校/科研机构的开源数据集话题

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