TNBC Data from Wu et al, 2021

Anndata format of the TNBC data set generated by Wu et al, 2021, together with inferred cytokine activity, as described in Dimitrov et al, 2022.<br> <br> <br> Wu, S.Z., Al-Eryani, G., Roden, D.L., Junankar, S., Harvey, K., Andersson, A., Thennavan, A., Wang, C., Torpy, J.R., Bartonicek, N. and Wang, T., 2021. A single-cell and spatially resolved atlas of human breast cancers. <em>Nature genetics</em>, <em>53</em>(9), pp.1334-1347.<br> <br> Dimitrov, D., Türei, D., Garrido-Rodriguez, M., Burmedi, P.L., Nagai, J.S., Boys, C., Ramirez Flores, R.O., Kim, H., Szalai, B., Costa, I.G. and Valdeolivas, A., 2022. Comparison of methods and resources for cell-cell communication inference from single-cell RNA-Seq data. <em>Nature Communications</em>, <em>13</em>(1), pp.1-13.本数据集包含Wu等人2021年构建的三阴性乳腺癌（Triple-Negative Breast Cancer, TNBC）数据集的Anndata（Anndata）格式文件，以及Dimitrov等人2022年研究中所描述的推断细胞因子活性数据。<br><br><br>Wu, S.Z.、Al-Eryani, G.、Roden, D.L. 等, 2021. 人类乳腺癌的单细胞与空间分辨图谱. 《自然·遗传学（*Nature Genetics*）》, 53(9), 第1334-1347页.<br><br><br>Dimitrov, D.、Türei, D.、Garrido-Rodriguez, M. 等, 2022. 单细胞RNA测序数据细胞间通讯推断的方法与资源比较. 《自然·通讯（*Nature Communications*）》, 13(1), 第1-13页.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是来自Wu等人2021年研究的三阴性乳腺癌（TNBC）单细胞和空间分辨率数据，以Anndata格式（.h5ad文件）提供，大小为600.28 MB，并包含Dimitrov等人2022年推断的细胞因子活性。它主要用于生物信息学和计算生物学领域的单细胞分析，支持细胞间通信推断等研究，具有较高的科学引用价值。