Additional file 1 of Symmetric subgenomes and balanced homoeolog expression stabilizes the establishment of allopolyploidy in cyprinid fish

<strong>Additional file 1: </strong>Supplementary Methods, Tables S1-S9, S11-S21, S24, S26-S36, and Figures S1-S35. <br> Reference: 10.1266/ggs.73.9 10.1186/s12863-017-0542-2 10.1093/bioinformatics/btp698 10.1093/bioinformatics/bty560 10.1016/j.cell.2014.11.021 10.1101/gr.215087.116 10.1101/gr.88502 10.1093/bioinformatics/bti1018 10.1186/1471-2105-9-18 10.1093/nar/gkm286 10.1126/sciadv.aaz7677 10.1038/s41467-019-12644-1 10.1101/gr.249805.119 10.1126/science.1072104 10.1093/dnares/dsu025 10.3390/md17070386 10.1186/s12864-017-3723-5 10.1534/genetics.114.164293 10.1186/s12864-015-2361-z 10.1038/ng.3098 10.1093/nar/gkr1293 10.1126/science.1153917 10.1101/gr.092759.109 10.1186/s12864-019-5965-x 10.1093/bioinformatics/btv710 10.1002/dvdy.24022 10.1007/978-1-4939-7315-6_11 10.1186/s13059-017-1229-8 10.1093/bioinformatics/btr167 10.1186/gb-2014-15-2-r38 10.1101/pdb.prot5439 10.1073/pnas.1512955113 10.1038/s41587-019-0201-4 10.1093/bioinformatics/btp352 10.1093/bfgp/elaa010 10.1038/s41598-017-14084-7 10.1101/gr.102491.109 10.1016/j.anireprosci.2014.09.012 10.1093/molbev/msn283 10.1371/journal.pone.0058453 10.1016/0044-8486(93)90141-K 10.1126/science.aba5216 10.1073/pnas.2010133117 10.1073/pnas.2005545117 10.1126/sciadv.aav0547