epi-2021-0077 Supplementary Tables 1–8 & Supplementary Figures 1–4

Supplementary table 1: Extended clinocopathological information of
donors.
Supplementary table 2: Primers sequences for qPCR analyses.
Supplementary table 3: Geomean
of raw CT values of reference genes beta-actin (βactin), Glyceraldehyde 3-phosphate
dehydrogenase (GAPDH) and Succinate Dehydrogenase Complex Flavoprotein
Subunit A (SDHA) for each donor and each tissue included in the gene-expression
analysis.
Supplementary table 4: Associations between potential confounding
variables sex, age, PMD, pH, Braak-score for gene-expression data.
Supplementary figure 1: QQ
plot of the p-values from discovery EWAS.
Supplementary table 5: Results of the linear mixed-effects model of
DNA methylation and the interaction term.
Supplementary table
6: Mean methylation
values. Methylation
values per DMR of SCZ and CTR samples, separated for grey and white matter.

Supplementary figure 2: Genome information
of the four DMRs of interest.
Supplementary table 7: Outcome variables for gene-expression data.
Supplementary figure 3: Association between gene expression and DMR methylation
in grey and white matter of the GFM and GTS in SCZ and CTR.
Supplementary figure 4: Principal
component analysis of the DMR methylation changes.

Supplementary table 8: Overlap with CPGs or
DMRs in previous genome-wide DNA methylation studies of SCZ.

补充表 1：捐献者扩展的临床病理信息。
补充表 2：qPCR 分析引物序列。
补充表 3：每个捐献者和每个纳入基因表达分析的组织的参考基因 β-肌动蛋白（βactin）、甘油醛-3-磷酸脱氢酶（GAPDH）和琥珀酸脱氢酶复合物黄素蛋白亚基 A（SDHA）的原始 CT 值的几何均数。
补充表 4：基因表达数据中性别、年龄、PMD、pH 和 Braak 评分等潜在混杂变量的关联。
补充图 1：发现全基因组关联性研究（EWAS）的 p 值的 QQ 图。
补充表 5：DNA 甲基化和交互项的线性混合效应模型结果。
补充表 6：平均甲基化值。根据 SCZ 和 CTR 样本的差异甲基化区域（DMR）的甲基化值，分别按灰质和白质分离。
补充图 2：四个感兴趣差异甲基化区域（DMR）的基因组信息。
补充表 7：基因表达数据的结果变量。
补充图 3：在 SCZ 和 CTR 的 GFM 和 GTS 的灰质和白质中，基因表达与 DMR 甲基化的关联。
补充图 4：DMR 甲基化变化的主成分分析。
补充表 8：与先前全基因组 DNA 甲基化研究中 SCZ 的 CPGs 或 DMR 的重叠。