组织器官发育中影响命运决定因子的表观修饰和标靶分析,以及与代谢物互作机制研究
收藏国家基础学科公共科学数据中心2026-01-30 收录
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https://nbsdc.cn/general/dataDetail?id=67d50dce195d260905af9751&type=1
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资源简介:
本数据集的概述如下:
数据内容:主要是测序数据,包括单细胞5’RNA高通量测序,及免疫细胞匹配的适应性免疫受体Adaptive Immune Receptor Repertoire (AIRR)测序。
采集方案:测序数据主要来自 HEK293T,HeLa,Jurkat和K562等细胞系,小鼠组织和人的外周血单个核细胞(PBMC),通过制备单细胞或单细胞核悬液,固定透化后利用FIPRESCI-seq技术进行建库测序。
采集地点:细胞系及小鼠样本由项目内实验室内培养,人样本通过在项目内郑州大学第一附属医院采集流产婴儿样本获得,上述均将进行伦理审批并与被采样者签署知情同意书。样本的单细胞提取、文库构建及各种处理在实验室内部进行,测序在诺禾致源、安诺优达等公司完成。
采集时间:2019 年 - 2023 年。
使用设备情况:测序数据将通过高通量测序仪上进行双端测序。
数据汇交:因为原始数据量特别巨大,所以本项目产生的科学数据拟归档到国家基因组科学数据中心(https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa-human)永久保存,ID为HRA001531。此外,本课题组在本重点研发计划项目支持下产出的其他单细胞组学数据,也同样归档到国家基因组科学数据中心,ID包括:HRA001532,HRA007205,HRA007355,HRA000757,HRA001573。
提供机构:
中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)



