Cattle and Sheep Whole Genome Sequence (WGS)

Cattle and Sheep Whole Genome Sequence (WGS)
USMARC Beef Cattle Diversity Panel (MBCDPv2.9)

Finished 14x WGS of 96 sires from 19 beef breeds representing >99% of the germplasm used in the US beef industry Article for cattle producers
USMARC Extended Cattle Diversity Panel (MECDPv1.0)
Ongoing 10x WGS from 46 breeds, includes MBCDPv2.9 sires plus four animals from each of 27 additional breeds
USMARC Sheep Diversity Panel (MSDPv2.4)
Finished 16x WGS of 96 rams from 10 US sheep breeds representing diversity in traits like fertility, growth, and longevity.
USMARC Extended Sheep Diversity Panel (MESDPv1.0)
Ongoing 10x WGS from 15 breeds, includes MSDPv2.4 rams plus 10 animals from each of 5 additional breeds
Related species (mapped to cattle and/or sheep)
Ongoing 10x WGS from related species like gaur, bison, banteng, and yak.
Livestock Cell Lines (mapped to cattle and/or sheep)

Ongoing 10x WGS from cell lines used in USMARC research like Madin-Darby Bovine Kidney (MDBK) cells.
Resources in this dataset:Resource Title: Cattle and Sheep Whole Genome Sequence (WGS). File Name: Web Page, url: https://www.ars.usda.gov/plains-area/clay-center-ne/marc/wgs/main/

牛肉和小型牲畜全基因组序列（WGS）
USMARC牛肉品种多样性组（MBCDPv2.9）
已完成，对19个牛肉品种的96头公牛进行14倍全基因组测序，这些品种代表了美国牛肉产业所使用种质资源的超过99%，适用于牛肉生产者。
USMARC扩展牛肉品种多样性组（MECDPv1.0）
持续进行中，对46个品种进行10倍全基因组测序，包括MBCDPv2.9的公牛，以及27个额外品种中每个品种的4头动物。
USMARC小型牲畜多样性组（MSDPv2.4）
已完成，对96头公羊进行16倍全基因组测序，来自10个美国小型牲畜品种，代表了在繁殖力、生长和长寿等性状上的多样性。
USMARC扩展小型牲畜多样性组（MESDPv1.0）
持续进行中，对15个品种进行10倍全基因组测序，包括MSDPv2.4的公羊，以及5个额外品种中每个品种的10头动物。
相关物种（映射到牛和/或羊）
持续进行中，对如亚洲野牛、美洲野牛、爪哇野牛和牦牛等相关物种进行10倍全基因组测序。
家畜细胞系（映射到牛和/或羊）
持续进行中，对在美国MARC研究中使用的细胞系进行10倍全基因组测序，如Madin-Darby牛肾（MDBK）细胞。
本数据集包含的资源：
资源标题：牛肉和小型牲畜全基因组序列（WGS）。文件名：网页，网址：https://www.ars.usda.gov/plains-area/clay-center-ne/marc/wgs/main/