WASPS

WASPS (Web-Assisted Symbolic Plasmid Synteny), a web service granting protein and DNA sequence similarity searches against a database comprising all completely sequenced natural plasmids from bacterial, archaeal and eukaryal origin. This database pre-calculates orthologous protein clustering and enables WASPS to generate fully resolved plasmid synteny maps in real time using internal and user-provided DNA sequences.

WASPS（Web-Assisted Symbolic Plasmid Synteny，网络辅助符号质粒共线性分析工具）是一款在线服务，可针对涵盖所有已完成完全测序的细菌、古菌及真核生物来源天然质粒的数据库，开展蛋白质与DNA序列相似性检索。该数据库预先完成了直系同源（orthologous）蛋白质聚类计算，可使WASPS依托内置及用户提供的DNA序列，实时生成完全解析的质粒共线性图谱。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

WASPS是一个基于网络的天然质粒数据服务器，提供蛋白质和DNA序列相似性搜索功能，其数据库包含所有已完全测序的天然质粒。该服务支持通过多种查询方式实时生成质粒同线性图谱，包括文本搜索和外部序列提交。