COTTONOMICS

we presented the cotton omics data platform COTTONOMICS (http://cotton.zju.edu.cn/), an easily accessible web database that integrates 32.5 TB of omics data including seven assembled genomes, resequencing data from 1180 allotetraploid cotton accessions and RNA-sequencing (RNA-seq), small RNA-sequencing (smRNA-seq), Chromatin Immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq), DNase hypersensitive sites sequencing (DNase-seq) and Bisulfite sequencing (BS-seq).

本研究构建并发布了棉花组学数据平台COTTONOMICS（访问网址：http://cotton.zju.edu.cn/），该平台为易用型网络数据库，整合了32.5TB的组学数据，涵盖7个已组装的基因组、1180份异源四倍体棉花种质的重测序数据，以及RNA测序（RNA-seq）、小RNA测序（smRNA-seq）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、DNase超敏位点测序（DNase-seq）与亚硫酸氢盐测序（BS-seq）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

COTTONOMICS是一个综合性的棉花组学数据库，专注于多倍体棉花的基因组学、变异分析和分子育种研究。它提供了基因组浏览器、变异搜索、表达数据等工具，支持棉花精准育种，并包含研究团队在棉花多倍体优势、基因组进化和重要农艺性状基因克隆方面的成果。该数据库定期更新，整合了多个棉花品种的基因组和重测序数据，旨在为棉花研究提供全面的生物信息学资源。