Plant Genome Integrative Explorer

The Plant Genome Integrative Explorer is a collection of interoperable web resources for searching, visualising and analysing genomics and transcriptomics data for different plant species. Currently, it includes dedicated web portals for enabling in-depth exploration of Poplar, Eucalyptus Norway spruce, and Arabidopsis and few more plant species. The PlantGenIE platform is based on the GenIE-Sys ( Genome Integrative Explorer System).

植物基因组整合探索器（Plant Genome Integrative Explorer）是一套可互操作的网络资源集合，用于检索、可视化及分析不同植物物种的基因组学与转录组学数据。目前，该平台包含专属网络门户，可对杨树、桉树、挪威云杉、拟南芥及其他数种植物物种开展深度探索分析。PlantGenIE平台基于GenIE-Sys（Genome Integrative Explorer System，基因组整合探索系统）构建。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Plant Genome Integrative Explorer（PlantGenIE）是一个集成式网络平台，专为多种植物物种的基因组和转录组数据提供搜索、可视化与分析功能。它覆盖了包括拟南芥、桉树、挪威云杉和杨树在内的众多植物，并配备BLAST、JBrowse等基因组工具以及表达和分析工具。该平台基于GenIE-Sys系统，旨在支持植物基因组学的深入探索。