ChannelsDB 2.0

ChannelsDB is a comprehensive and regularly updated resource of channels, pores and tunnels found in biomacromolecules deposited in the Protein Data Bank. The database contains information about channel positions, geometry and physicochemical properties.通道数据库（ChannelsDB）是一款全面且定期更新的资源库，收录了存储于蛋白质数据银行（Protein Data Bank，PDB）中的生物大分子内的通道、孔隙与隧道结构相关信息。该数据库包含了此类结构的位置、几何形态以及理化性质等详细信息。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

ChannelsDB 2.0是一个综合且定期更新的资源，收录了来自Protein Data Bank和AlphaFill/AlphaFold数据库的生物大分子中的通道、孔和隧道信息。它使用CAVER和MOLE算法计算路径，提供通道位置、几何和理化性质数据，并与UniProt数据库交叉链接，以交互方式便于数据解读。