InnateDB

InnateDB is a publicly available database of the genes, proteins, experimentally-verified interactions and signaling pathways involved in the innate immune response of humans, mice and bovines to microbial infection. The database captures an improved coverage of the innate immunity interactome by integrating known interactions and pathways from major public databases together with manually-curated data into a centralised resource. The database can be mined as a knowledgebase or used with our integrated bioinformatics and visualization tools for the systems level analysis of the innate immune response.

InnateDB乃一项公开发布的数据库，收录了人类、小鼠和牛类对微生物感染产生的天然免疫反应中涉及的基因、蛋白质、经实验验证的相互作用以及信号通路。该数据库通过整合主要公共数据库中的已知相互作用和通路，以及手动编纂的数据，构建了一个中央资源，从而提升了天然免疫相互作用组的覆盖范围。数据库可被用作知识库，亦可用我方集成的生物信息学和可视化工具进行天然免疫反应的系统级分析。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

InnateDB是一个专注于先天免疫反应的公开数据库，整合了人类、小鼠和牛的基因、蛋白质、实验验证的相互作用及信号通路数据，包含超过27,000个整理过的相互作用和367,000个总相互作用。该数据库结合了公共数据库资源和手动整理内容，提供生物信息学分析工具，支持系统生物学研究，并覆盖生命科学、医学和免疫学等多个学科领域。