FAIRsharing record for: FerrDb V2

This FAIRsharing record describes: FerrDb V2 contains 1001 ferroptosis regulators and 143 ferroptosis-disease associations manually curated from 3288 articles. Specifically, there are 621 gene regulators, of which 264 are drivers, 238 are suppressors, 9 are markers, and 110 are unclassified genes; and there are 380 substance regulators, with 201 inducers and 179 inhibitors. Compared to FerrDb V1, curated articles increase by > 300%, ferroptosis regulators increase by 175%, and ferroptosis-disease associations increase by 50.5%. Circular RNA and pseudogene are novel regulators in FerrDb V2, and the percentage of non-coding RNA increases from 7.3% to 13.6%. External gene-related data were integrated, enabling thought-provoking and gene-oriented analysis in FerrDb V2.

本FAIRsharing记录描述如下：FerrDb V2包含1001个铁死亡（ferroptosis）调控因子与143条经人工从3288篇文献中甄选整理得到的铁死亡-疾病关联数据。具体而言，该数据库涵盖621个基因类调控因子，其中264个为激活剂（drivers）、238个为抑制剂（suppressors）、9个为标记物（markers），另有110个未分类基因；同时包含380个物质类调控因子，含201种诱导剂（inducers）与179种抑制剂（inhibitors）。相较于FerrDb V1版本，本次更新的人工整理文献量提升超300%，铁死亡调控因子总量增长175%，铁死亡-疾病关联数据增加50.5%。环状RNA（Circular RNA）与假基因（pseudogene）为FerrDb V2新增的调控因子类型，非编码RNA（non-coding RNA）的占比从7.3%提升至13.6%。此外，FerrDb V2还整合了外部基因相关数据，可支持兼具启发性与基因导向性的分析研究。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

FerrDb V2是一个专注于铁死亡调节因子的知识库，包含1001个手动整理的调节因子和143个铁死亡-疾病关联，数据来源于3288篇文章。与前一版本相比，该数据集在数据规模上有显著扩展，新增了环状RNA和假基因作为调节因子，并整合了外部基因数据以支持深入分析。数据集由中国开发，创建于2022年，主题涉及生物信息学和数据整合。