CORESH

CORESH, a web server designed to systematically find GEO datasets that match a user-provided gene signature-such as a list of top upregulated genes in response to a treatment-in a data-driven manner. A common scenario for utilizing this resource is to show transcriptional similarity of one's own data to a public dataset as evidence of potentially similar biology.CORESH是一款专为系统化检索匹配用户自定义基因特征（gene signature）的GEO数据集（Gene Expression Omnibus）而开发的在线Web服务器，其检索全程以数据驱动模式开展——此类基因特征的典型示例为某处理条件下的上调基因Top列表。该工具的典型应用场景为：通过比对自身实验数据与公共数据集的转录组相似性，为潜在的保守生物学机制提供实证依据。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CORESH是一个共调控搜索引擎，支持人类（Homo Sapiens）和小鼠（Mus Musculus）的基因集查询，允许输入10-200个基因（上限500个）并计算P值，免费提供使用（包括商业用途）。该数据集主要用于基因表达调控分析，便于研究基因间的共调控关系。