高温胁迫烟粉虱分子生物学实验数据集

本数据集来源于烟粉虱MED/MEAM1隐种在常温对照及梯度高温胁迫（37–43℃）下的分子生物学实验，涵盖总RNA质量参数、热激基因（Hsp70、Hsp90、Hsp40、Hsf等）qRT-PCR原始Ct值、熔解曲线数据及部分样本转录组（RNA-seq）测序信息。处理流程如下：
数据清洗：剔除隐种鉴定、处理温度、基因名称或Ct值缺失记录；过滤RNA质量不合格（RIN＜6.0、28S/18S＜1.0）及qPCR扩增效率超出90%–110%范围的样本；删除三复孔Ct值标准差＞0.5的异常数据，保留生物学重复≥3的有效样本。
标准化处理：qRT-PCR数据以持家基因（β-actin/EF-1α）为内参，按2^(-ΔΔCt)算法换算为目的基因相对表达量；RNA-seq原始Reads Count统一转换为TPM并做log2(x+1)变换，采用ComBat算法校正批次效应；高温胁迫温度、时长及虫态按受控词表编码。
数据结构化：将虫体基础信息表、高温处理参数表、基因表达矩阵及差异分析结果表按样本ID关联，整理为带统计学标签（log2FC、FDR）的结构化宽表，对采样地坐标及实验人信息去标识化处理

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集聚焦烟粉虱MED/MEAM1隐种在常温及37–43℃梯度高温胁迫下的分子生物学实验数据，涵盖总RNA质量参数、热激基因qRT-PCR原始Ct值及部分样本转录组测序信息。数据经过严格的清洗和标准化处理（如以持家基因为内参的2^(-ΔΔCt)换算、TPM转换及批次校正），形成了带统计学标签的结构化宽表，主要用于研究害虫高温适应机制和支撑农业害虫绿色防控技术研发。