Mouse organogenesis seqFISH E8.5

AnnData object, containing seqFISH expression values of Lohoff et al., Nature Biotechnology 2022.Contains raw data for 51,787 cells and 351 genes across all three embryos, as well as cell type annotations and embeddings. Data corresponds to E8.5-8.75.

本数据集为AnnData 对象（AnnData），包含Lohoff等人2022年发表于《自然-生物技术（Nature Biotechnology）》的序列荧光原位杂交（seqFISH）表达量值。该数据集涵盖全部3枚胚胎的51787个细胞与351个基因的原始数据，同时包含细胞类型注释与嵌入向量（embeddings），对应胚胎发育第8.5至8.75天阶段。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集提供了E8.5-8.75时期小鼠器官发育的seqFISH表达数据，包含51,787个细胞和351个基因的原始数据，以及细胞类型注释和嵌入信息，适用于空间转录组学和单细胞基因组学研究。