穗花杉的转录组测序及其转录组特性分析
收藏国家林业和草原科学数据中心2022-11-30 更新2024-03-06 收录
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资源简介：
[目的]通过对红豆杉科穗花杉属的穗花杉进行转录组测序,为穗花杉的萜类合成途径和分类学研究提供支持。[方法]利用Hi Seq2500技术对穗花杉的茎叶进行转录组测序。[结果]穗花杉转录组测序共得到8.14 Gb的clean data。从头组装共获得82 884条unigene,其中有27 495条unigene被注释。此外,在82 884条unigene中共搜索到2 827个SSR位点,单核苷酸重复SSR出现频率最高（60.1%）,其次为三核苷酸重复SSR（25.4%）。在穗花杉unigene中挖掘出了1个牦牛儿基焦磷酸合成酶（GPS）、1个法尼烯基焦磷酸合成酶（FPS）和5个牦牛儿基牦牛儿基焦磷酸合成酶（GGPS）的同源基因,同时得到紫杉二烯合成酶（TS）同源基因13个。
提供机构：
国家林业和草原科学数据中心
创建时间：
2022-11-30
