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LNCTRN database provides comprehensive information regarding both cis-regulation and trans-regulation by lncRNAs in protate cancer, based on bioinformatics prediction from the Cancer Genome Atlas (TCGA) and the GTRD ChIP-Seq collection.

LNCTRN数据库基于癌症基因组图谱(Cancer Genome Atlas, TCGA)与GTRD染色质免疫共沉淀测序(ChIP-Seq)数据集的生物信息学预测结果,提供了前列腺癌中长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNAs)所介导的顺式调控与反式调控的全面信息。

提供机构:
复旦大学
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数据集介绍
LNCTRN 数据集图片
背景与挑战
背景概述
LNCTRN数据库是一个专注于长链非编码RNA(lncRNAs)在前列腺癌中转录调控的资源。它基于癌症基因组图谱(TCGA)和GTRD ChIP-Seq集合的生物信息学预测,提供lncRNAs在顺式和反式调控方面的全面信息。该数据库旨在帮助研究人员理解lncRNAs在疾病中的调控机制。
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