CATH

The CATH database is a free, publicly available online resource that provides information on the evolutionary relationships of protein domains. It provides a hierarchical domain classification of protein structures in the Protein Data Bank. Protein structures are classified using a combination of automated and manual procedures. There are four major levels in this hierarchy; Class (secondary structure classification, e.g. mostly alpha), Architecture (classification based on overall shape), Topology (fold family) and Homologous superfamily (protein domains which are thought to share a common ancestor).CATH数据库（CATH Database）是一款免费且公开可用的在线资源，用于提供蛋白质结构域（Protein Domains）的进化关系相关信息。该数据库对蛋白质数据银行（Protein Data Bank）收录的蛋白质结构开展层级化结构域分类工作。蛋白质结构的分类流程结合了自动化操作与人工审核两种方式。该层级体系共包含四大核心层级：类别（Class，基于二级结构的分类标准，例如以α螺旋为主的结构）、架构（Architecture，依据整体空间构象划分的类别）、拓扑结构（Topology，即折叠家族）以及同源超家族（Homologous superfamily，被认为拥有共同进化祖先的蛋白质结构域）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CATH是一个公开的蛋白质结构分类数据库，基于从蛋白质数据库（PDB）下载的结构，将蛋白质结构域按进化关系分层分类到超家族。它提供三维结构分析、蛋白质进化、功能和保守位点研究，并包含CATH-Gene3D资源的最新版本数据。