Mapa genético de Megathyrsus maximus (Jacq.), com informação de dosagem alélica e fase de ligação.
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Mapa genético de Megathyrsus maximus (Jacq.), com informação de dosagem alélica e fase de ligação. Este corresponde ao mapa de ligação mais denso e informativo para a espécie, até o momento, com 7095 marcadores, abrangendo 1746.18 cM do genoma. Foi gerado a partir de uma população biparental de 224 indivíduos, os quais foram sequenciados por meio do protocolo de Genotipagem por sequenciamento (GBS). Os dados brutos de sequenciamento foram analisados para encontrar variantes e estimar as dosagens alélicas para ambos os pais e todos os indivíduos da população. Cinco genomas de referência de espécies relacionadas foram utilizados durante o processo de mapeamento, devido à ausência de um genoma de referência para M. maximus. O software GATK v.4.1.6.0 foi utilizado para encontrar as variantes e estimar os genótipos. O software MAPpoly v0.2.3 foi utilizado para a construção do mapa.
提供机构:
Redape
创建时间:
2023-09-19



