CanMethdb

We developed a comprehensive DNA methylation database, called CanMethdb, which aims to provide genome-wide mapping of methylation sites to target genes through integrating a large number of DNA methylation and gene expression profiles in human diseases, and to annotate methylation sites to abundant regulatory elements and TFs.我们构建了一款名为CanMethdb的综合性DNA甲基化（DNA methylation）数据库。该数据库旨在通过整合人类疾病中的海量DNA甲基化与基因表达谱数据，实现甲基化位点至靶基因的全基因组定位，并将甲基化位点注释至大量调控元件与转录因子（Transcription Factors，TFs）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CanMethdb是一个全面的DNA甲基化数据库，旨在通过整合人类疾病中的大量DNA甲基化和基因表达谱，提供全基因组甲基化位点到靶基因的映射，并对甲基化位点进行丰富的调控元件和转录因子注释。该数据库当前版本包含数千万个CpG-靶基因对，支持多种调控元素分析和可视化功能，还提供3D验证、通路富集及调控子网络分析等工具。