多能性相关lncRNA Oplr16所结合的染色质DNA测序及去甲基化酶TET2所结合的多能lncRNA测序

多能性特异性染色质网络的形成是体细胞重编程进入多能性状态的关键事件。为了描述这一过程中的调控成分，我们使用“染色质RNA原位逆转录测序”(CRIST-seq)来分析与多能性主基因Oct4相互作用的RNA成分。利用这种方法，我们发现了一个与重编程启动密切相关的新型核lncRNA Oplr16。Oplr16不仅与Oct4启动子相互作用并调节其活性，而且在重编程为多能性的过程中也被特异性激活。Oplr16的积极表达是维持胚胎干细胞多能性的最佳条件。Oplr16还能促进成纤维细胞向多能细胞的重编程。RNA逆转录相关陷阱测序(RAT-seq)表明，Oplr16与多个与干细胞自我更新相关的靶基因相互作用。值得注意的是，Oplr16利用其3 -片段招募染色质因子SMC1来协调多能特异性染色体内环。在与Oct4启动子结合后，Oplr16招募TET2诱导DNA去甲基化并激活成纤维细胞中的Oct4，导致增强的重编程。这些数据表明，Oplr16可能作为一个关键的染色质因子，通过调节染色质结构和DNA去甲基化来控制干细胞的命运。