相关数据集
PerturbQA
该数据集是对扰动实验的结构化推理的基准，重点关注对未见扰动条件下差异表达预测和变化方向的研究，同时包含基因集富集分析。该数据集还包括对最先进的机器学习和统计方法在建模扰动方面的评估，强调在此领域需要改进方法。任务涵盖了差异表达预测、变化方向预测以及基因集富集分析。
arXiv300
Etv5 ChIP-seq in AT2 cells
Alveolar type II (AT2) cell dysfunction contributes to a number of significant human pathologies including respiratory distress syndrome, lung adenocarcinoma, and debilitating fibrotic diseases, bu
干细胞与再生医学数据中心2022-02-20 更新150
Genentech/microglia-scatac-tutorial-data
该数据集包含人类小胶质细胞的伪批量scATAC-seq数据，源自Corces等人（2020）的研究（https://www.nature.com/articles/s41588-020-00721-x）。基因组坐标对应于hg38参考基因组。此数据用于gReLU教程3（https://github.com/Genentech/gReLU/blob/main/docs/tutorials/3_trai
Hugging Face2026-02-24 更新120
Irf6 wildtype and knock out ATAC-seq
The integrity of the mammalian epidermis is essential for organism survival, and it depends on a balance of proliferation and differentiation in the resident stem cell population. The kinase Ripk4 and
干细胞与再生医学数据中心2022-02-20 更新160
Genentech/enformer-data
该数据集包含了用于训练、验证和测试Enformer模型的特定基因组区间，Enformer模型是一个深度学习架构，用于从DNA序列预测功能基因组轨迹。区间提供了人类和小鼠基因组的版本。按照出版物中的方法，我们使用hg38参考基因组将Basenji2数据集的输入序列从原来的131,072 bp扩展到196,608 bp。数据集包含两个TSV文件，分别对应人类（hg38）和小鼠（mm10）的基因组区间，
Hugging Face2026-02-23 更新130
