Parasteatoda tepidariorum genome annotations v0.5.3
收藏agdatacommons.nal.usda.gov2024-02-13 更新2025-01-21 收录
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资源简介:
This dataset presents the Parasteatoda tepidariorum gene set BCM_v_0.5.3. RNA-Seq data was used with additional protein homology data for a MAKER automated annotation of the Parasteatoda tepidariorum genome assembly 1.0. This dataset is free for all use. Resources in this dataset:Resource Title: Parasteatoda tepidariorum genome annotations v0.5.3. File Name: partep_BCM_version_0.5.3.tar.gzResource Description: The attached tar.gz archive (partep_BCM_version_0.5.3.tar.gz) contains the following files:
PTEP.CDS.fna. CDS sequences of the genome annotations v0.5.3.
PTEP.faa. Amino acid sequences of the genome annotations v0.5.3.
PTEP.fna. cDNA sequences of the genome annotations v0.5.3.
PTEP.Models.gff3. Gff3 of all gene predictions of the genome annotations v0.5.3.
PTEP.Analysis.gff3 Gff3 of all evidence contributing to the genome annotations v0.5.3.
本数据集展示了Parasteatoda tepidariorum基因集BCM_v_0.5.3的RNA-Seq数据,并辅以额外的蛋白质同源性数据,以实现对Parasteatoda tepidariorum基因组组装1.0版本的MAKER自动化注释。该数据集对所有用户免费开放。数据集中包含以下资源:
资源标题:Parasteatoda tepidariorum基因组注释v0.5.3。
文件名:partep_BCM_version_0.5.3.tar.gz
资源描述:所附的tar.gz压缩包(partep_BCM_version_0.5.3.tar.gz)包含以下文件:
PTEP.CDS.fna. 基因组注释v0.5.3的CDS序列。
PTEP.faa. 基因组注释v0.5.3的氨基酸序列。
PTEP.fna. 基因组注释v0.5.3的cDNA序列。
PTEP.Models.gff3. 基因组注释v0.5.3中所有基因预测的Gff3文件。
PTEP.Analysis.gff3. 基因组注释v0.5.3中所有贡献证据的Gff3文件。
提供机构:
Ag Data Commons



