Information Commons for Rice

Information Commons for Rice (IC4R) is a rice knowledgebase that incorporates rice data through multiple modules such as genome-wide expression profiles derived entirely from RNA-Seq data, resequencing-based genomic variations obtained from re-sequencing data of thousands of rice varieties, plant homologous genes covering multiple diverse plant species, post-translational modifications, rice-related literatures and gene annotations contributed by the rice research community.

水稻信息共享库（Information Commons for Rice，IC4R）是一款专业化水稻知识库，通过多个模块整合水稻相关数据，具体包括：完全基于RNA测序（RNA-Seq）数据生成的全基因组表达谱、源自数千份水稻品种重测序数据的基因组变异信息、覆盖多种不同植物物种的植物同源基因数据、蛋白质翻译后修饰信息，以及水稻相关文献与水稻研究社群贡献的基因注释数据。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Information Commons for Rice (IC4R) 是一个水稻知识库，整合了多种数据模块，包括全基因组表达谱、基因组变异、植物同源基因、翻译后修饰、相关文献和基因注释。这些数据来源于RNA-Seq、水稻品种重测序以及研究社区的贡献，旨在为水稻研究提供全面的信息资源。