AthRiboNC
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AthRiboNC integrates Ribo-seq data from 226 experiments to reveal the coding potential of Arabidopsis ncRNAs, cataloguing 2 743 lncRNAs, 255 miRNAs, 1 871 circRNAs and 40 162 translated sORFs, with tools for expression specificity, co-expression networking, module enrichment and BLAST search.
AthRiboNC数据集整合了来自226项实验的核糖体测序（Ribo-seq）数据，以揭示拟南芥非编码RNA（ncRNAs）的编码潜能；该数据集共收录2743条长链非编码RNA（lncRNAs）、255条微小RNA（miRNAs）、1871条环状RNA（circRNAs）以及40162个可翻译的小开放阅读框（sORFs），并提供了表达特异性分析、共表达网络构建、模块富集分析及BLAST搜索工具。
提供机构：
Zhejiang University创建时间：
2025-06-30
搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
AthRiboNC是一个专注于拟南芥的数据集，利用Ribo-seq数据揭示非编码RNA（如lncRNA、miRNA、circRNA）的编码潜力。它提供下游分析功能，包括编码潜力特异性评估、共表达网络分析和模块富集分析，支持植物非编码肽功能研究。
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